Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RxraP28700 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RxraP28700 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RxraP28700 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RxraP28700 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RxraP28700 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RxraP28700 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RxraP28700 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RxraP28700 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RxraP28700 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RxraP28700 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RxraP28700 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RxraP28700 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RxraP28700 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RxraP28700 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RxraP28700 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RxraP28700 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RxraP28700 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RxraP28700 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RxraP28700 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RxraP28700 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RxraP28700 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RxraP28700 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RxraP28700 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RxraP28700 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RxraP28700 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RxraP28700 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RxraP28700 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RxraP28700 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RxraP28700 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RxraP28700 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RxraP28700 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RxraP28700 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RxraP28700 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RxraP28700 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RxraP28700 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RxraP28700 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RxraP28700 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RxraP28700 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RxraP28700 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RxraP28700 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RxraP28700 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RxraP28700 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RxraP28700 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RxraP28700 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RxraP28700 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RxraP28700 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RxraP28700 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RxraP28700 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RxraP28700 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RxraP28700 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RxraP28700 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RxraP28700 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RxraP28700 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RxraP28700 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RxraP28700 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RxraP28700 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RxraP28700 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RxraP28700 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RxraP28700 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RxraP28700 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RxraP28700 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RxraP28700 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RxraP28700 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RxraP28700 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RxraP28700 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RxraP28700 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RxraP28700 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RxraP28700 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RxraP28700 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RxraP28700 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RxraP28700 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RxraP28700 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RxraP28700 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RxraP28700 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RxraP28700 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RxraP28700 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RxraP28700 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RxraP28700 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RxraP28700 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RxraP28700 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RxraP28700 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RxraP28700 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RxraP28700 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RxraP28700 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RxraP28700 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RxraP28700 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RxraP28700 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RxraP28700 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RxraP28700 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RxraP28700 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RxraP28700 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RxraP28700 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RxraP28700 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RxraP28700 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RxraP28700 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RxraP28700 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RxraP28700 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RxraP28700 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RxraP28700 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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