Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxd9P28357 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd9P28357 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd9P28357 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd9P28357 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd9P28357 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd9P28357 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd9P28357 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd9P28357 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd9P28357 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd9P28357 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd9P28357 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd9P28357 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd9P28357 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd9P28357 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd9P28357 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd9P28357 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd9P28357 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd9P28357 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd9P28357 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd9P28357 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd9P28357 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd9P28357 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd9P28357 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd9P28357 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd9P28357 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd9P28357 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd9P28357 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd9P28357 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd9P28357 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd9P28357 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd9P28357 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd9P28357 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd9P28357 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd9P28357 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd9P28357 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd9P28357 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd9P28357 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms