Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LoxP28301 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LoxP28301 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LoxP28301 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LoxP28301 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LoxP28301 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LoxP28301 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LoxP28301 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LoxP28301 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LoxP28301 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LoxP28301 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LoxP28301 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LoxP28301 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LoxP28301 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LoxP28301 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LoxP28301 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LoxP28301 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LoxP28301 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LoxP28301 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LoxP28301 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LoxP28301 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LoxP28301 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LoxP28301 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LoxP28301 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LoxP28301 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LoxP28301 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LoxP28301 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LoxP28301 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LoxP28301 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LoxP28301 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LoxP28301 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LoxP28301 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LoxP28301 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LoxP28301 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LoxP28301 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LoxP28301 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LoxP28301 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LoxP28301 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LoxP28301 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LoxP28301 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LoxP28301 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LoxP28301 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LoxP28301 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LoxP28301 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LoxP28301 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LoxP28301 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LoxP28301 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LoxP28301 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LoxP28301 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LoxP28301 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LoxP28301 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LoxP28301 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LoxP28301 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LoxP28301 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LoxP28301 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LoxP28301 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LoxP28301 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LoxP28301 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LoxP28301 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LoxP28301 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LoxP28301 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LoxP28301 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LoxP28301 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LoxP28301 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LoxP28301 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LoxP28301 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LoxP28301 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LoxP28301 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LoxP28301 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LoxP28301 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LoxP28301 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LoxP28301 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LoxP28301 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LoxP28301 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LoxP28301 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LoxP28301 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LoxP28301 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LoxP28301 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LoxP28301 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LoxP28301 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LoxP28301 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LoxP28301 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LoxP28301 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LoxP28301 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LoxP28301 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LoxP28301 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LoxP28301 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LoxP28301 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LoxP28301 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LoxP28301 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LoxP28301 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LoxP28301 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LoxP28301 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LoxP28301 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LoxP28301 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LoxP28301 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LoxP28301 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LoxP28301 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LoxP28301 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LoxP28301 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms