Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
H2-DMaP28078 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-DMaP28078 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms