Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CenpbP27790 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CenpbP27790 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CenpbP27790 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CenpbP27790 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CenpbP27790 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CenpbP27790 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CenpbP27790 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CenpbP27790 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CenpbP27790 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms