Protein–RNA interactions for Protein: P24699

Myf5, Myogenic factor 5, mousemouse

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Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myf5P24699 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myf5P24699 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myf5P24699 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myf5P24699 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myf5P24699 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myf5P24699 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myf5P24699 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Myf5P24699 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myf5P24699 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Myf5P24699 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms