Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gja1P23242 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gja1P23242 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gja1P23242 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gja1P23242 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gja1P23242 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gja1P23242 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gja1P23242 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gja1P23242 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Gja1P23242 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Gja1P23242 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gja1P23242 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gja1P23242 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gja1P23242 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gja1P23242 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gja1P23242 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gja1P23242 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gja1P23242 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gja1P23242 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gja1P23242 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gja1P23242 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gja1P23242 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gja1P23242 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gja1P23242 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gja1P23242 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gja1P23242 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gja1P23242 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gja1P23242 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gja1P23242 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gja1P23242 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Gja1P23242 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gja1P23242 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gja1P23242 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gja1P23242 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gja1P23242 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gja1P23242 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gja1P23242 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gja1P23242 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gja1P23242 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gja1P23242 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gja1P23242 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gja1P23242 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gja1P23242 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gja1P23242 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gja1P23242 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gja1P23242 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gja1P23242 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gja1P23242 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gja1P23242 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gja1P23242 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gja1P23242 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gja1P23242 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gja1P23242 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gja1P23242 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gja1P23242 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gja1P23242 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja1P23242 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja1P23242 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja1P23242 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gja1P23242 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms