Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Eif3aP23116 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Eif3aP23116 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Eif3aP23116 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Eif3aP23116 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Eif3aP23116 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Eif3aP23116 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Eif3aP23116 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Eif3aP23116 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Eif3aP23116 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Eif3aP23116 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Eif3aP23116 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Eif3aP23116 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Eif3aP23116 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Eif3aP23116 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Eif3aP23116 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Eif3aP23116 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Eif3aP23116 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Eif3aP23116 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Eif3aP23116 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Eif3aP23116 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Eif3aP23116 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Eif3aP23116 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Eif3aP23116 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Eif3aP23116 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Eif3aP23116 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Eif3aP23116 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Eif3aP23116 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Eif3aP23116 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Eif3aP23116 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Eif3aP23116 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms