Protein–RNA interactions for Protein: P22646

Cd3e, T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eP22646 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd3eP22646 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms