Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnnc2P20801 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnnc2P20801 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms