Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Prim1P20664 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prim1P20664 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prim1P20664 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prim1P20664 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Prim1P20664 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prim1P20664 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Prim1P20664 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prim1P20664 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prim1P20664 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prim1P20664 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms