Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P20040 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P20040 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P20040 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P20040 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P20040 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P20040 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P20040 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P20040 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P20040 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P20040 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P20040 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P20040 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
P20040 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P20040 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P20040 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P20040 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P20040 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P20040 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P20040 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
P20040 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P20040 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P20040 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P20040 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P20040 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P20040 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P20040 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P20040 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P20040 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P20040 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P20040 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
P20040 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P20040 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P20040 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P20040 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P20040 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P20040 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P20040 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P20040 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P20040 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P20040 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P20040 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P20040 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P20040 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P20040 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P20040 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P20040 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P20040 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P20040 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P20040 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P20040 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P20040 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P20040 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
P20040 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P20040 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P20040 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P20040 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P20040 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P20040 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P20040 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P20040 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P20040 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P20040 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P20040 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P20040 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P20040 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P20040 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
P20040 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P20040 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P20040 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P20040 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P20040 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P20040 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P20040 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P20040 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P20040 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P20040 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P20040 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P20040 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P20040 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P20040 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P20040 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P20040 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P20040 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P20040 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P20040 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P20040 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P20040 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P20040 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P20040 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P20040 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P20040 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P20040 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P20040 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P20040 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P20040 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P20040 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P20040 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P20040 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P20040 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms