Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18528 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18528 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18528 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18528 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18528 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18528 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18528 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18528 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P18528 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P18528 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P18528 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18528 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18528 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18528 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18528 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18528 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18528 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18528 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18528 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P18528 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18528 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18528 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18528 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18528 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18528 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18528 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18528 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18528 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18528 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18528 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18528 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18528 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18528 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18528 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18528 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18528 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18528 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P18528 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18528 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18528 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18528 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18528 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18528 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18528 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18528 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18528 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18528 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18528 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18528 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18528 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18528 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18528 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18528 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18528 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18528 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18528 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18528 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18528 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18528 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18528 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18528 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18528 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18528 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18528 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18528 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18528 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P18528 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18528 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P18528 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18528 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18528 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P18528 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18528 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18528 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18528 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18528 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18528 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18528 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P18528 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18528 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18528 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18528 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18528 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18528 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18528 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18528 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18528 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18528 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18528 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18528 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P18528 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18528 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18528 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P18528 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P18528 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P18528 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18528 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18528 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18528 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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