Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb1P17919 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb1P17919 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 220.5 ms