Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcnaP17918 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PcnaP17918 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcnaP17918 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
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PcnaP17918 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PcnaP17918 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PcnaP17918 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
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PcnaP17918 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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PcnaP17918 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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PcnaP17918 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PcnaP17918 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PcnaP17918 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PcnaP17918 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PcnaP17918 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PcnaP17918 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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