Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pou4f1P17208 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pou4f1P17208 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 834.7 ms