Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb2P13373 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vpreb2P13373 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms