Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vpreb1P13372 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vpreb1P13372 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms