Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcl1P12850 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cxcl1P12850 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cxcl1P12850 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cxcl1P12850 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cxcl1P12850 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cxcl1P12850 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl1P12850 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl1P12850 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl1P12850 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms