Protein–RNA interactions for Protein: P11983

Tcp1, T-complex protein 1 subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp1P11983 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcp1P11983 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tcp1P11983 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tcp1P11983 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tcp1P11983 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tcp1P11983 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcp1P11983 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcp1P11983 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcp1P11983 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcp1P11983 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcp1P11983 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcp1P11983 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcp1P11983 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcp1P11983 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcp1P11983 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcp1P11983 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcp1P11983 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcp1P11983 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcp1P11983 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcp1P11983 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcp1P11983 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcp1P11983 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcp1P11983 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcp1P11983 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcp1P11983 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcp1P11983 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcp1P11983 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms