Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fv4P11370 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fv4P11370 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Fv4P11370 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fv4P11370 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms