Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CatspereP0DP43 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CatspereP0DP43 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms