Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Amd1P0DMN7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms