Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ly6c1P0CW02 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ly6c1P0CW02 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms