Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UbbP0CG49 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UbbP0CG49 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms