Protein–RNA interactions for Protein: P09920

Csf3, Granulocyte colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3P09920 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csf3P09920 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csf3P09920 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Csf3P09920 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csf3P09920 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csf3P09920 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csf3P09920 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csf3P09920 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csf3P09920 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csf3P09920 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csf3P09920 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csf3P09920 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf3P09920 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf3P09920 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms