Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb5P09079 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb5P09079 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms