Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxc8P09025 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Hoxc8P09025 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc8P09025 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms