Protein–RNA interactions for Protein: P08775

Polr2a, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2aP08775 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr2aP08775 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2aP08775 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2aP08775 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2aP08775 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2aP08775 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2aP08775 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2aP08775 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2aP08775 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2aP08775 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2aP08775 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2aP08775 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr2aP08775 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Polr2aP08775 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Polr2aP08775 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Polr2aP08775 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Polr2aP08775 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Polr2aP08775 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Polr2aP08775 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Polr2aP08775 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Polr2aP08775 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Polr2aP08775 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Polr2aP08775 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Polr2aP08775 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr2aP08775 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr2aP08775 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr2aP08775 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr2aP08775 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr2aP08775 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr2aP08775 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr2aP08775 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr2aP08775 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr2aP08775 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr2aP08775 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr2aP08775 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr2aP08775 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr2aP08775 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr2aP08775 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr2aP08775 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr2aP08775 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr2aP08775 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms