Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spta1P08032 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spta1P08032 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spta1P08032 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spta1P08032 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spta1P08032 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spta1P08032 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spta1P08032 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Spta1P08032 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spta1P08032 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Spta1P08032 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms