Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifna4P07351 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifna4P07351 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms