Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TtrP07309 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtrP07309 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtrP07309 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtrP07309 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtrP07309 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtrP07309 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtrP07309 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtrP07309 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TtrP07309 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtrP07309 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtrP07309 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TtrP07309 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TtrP07309 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TtrP07309 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TtrP07309 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TtrP07309 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TtrP07309 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TtrP07309 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TtrP07309 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TtrP07309 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TtrP07309 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TtrP07309 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TtrP07309 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TtrP07309 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TtrP07309 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TtrP07309 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TtrP07309 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TtrP07309 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TtrP07309 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TtrP07309 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TtrP07309 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TtrP07309 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TtrP07309 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TtrP07309 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TtrP07309 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TtrP07309 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TtrP07309 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TtrP07309 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TtrP07309 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TtrP07309 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtrP07309 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtrP07309 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtrP07309 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtrP07309 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtrP07309 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtrP07309 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtrP07309 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtrP07309 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtrP07309 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtrP07309 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtrP07309 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtrP07309 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtrP07309 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtrP07309 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtrP07309 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TtrP07309 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtrP07309 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtrP07309 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TtrP07309 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtrP07309 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtrP07309 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtrP07309 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtrP07309 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtrP07309 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtrP07309 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtrP07309 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtrP07309 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtrP07309 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtrP07309 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtrP07309 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TtrP07309 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
TtrP07309 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtrP07309 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtrP07309 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtrP07309 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TtrP07309 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TtrP07309 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TtrP07309 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TtrP07309 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TtrP07309 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtrP07309 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtrP07309 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtrP07309 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtrP07309 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtrP07309 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtrP07309 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtrP07309 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtrP07309 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtrP07309 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtrP07309 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtrP07309 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtrP07309 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtrP07309 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtrP07309 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtrP07309 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtrP07309 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtrP07309 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtrP07309 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TtrP07309 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms