Protein–RNA interactions for Protein: P05524

Fgf3, Fibroblast growth factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf3P05524 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fgf3P05524 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fgf3P05524 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fgf3P05524 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fgf3P05524 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fgf3P05524 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fgf3P05524 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fgf3P05524 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fgf3P05524 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fgf3P05524 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fgf3P05524 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fgf3P05524 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fgf3P05524 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fgf3P05524 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fgf3P05524 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fgf3P05524 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fgf3P05524 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fgf3P05524 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fgf3P05524 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fgf3P05524 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fgf3P05524 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fgf3P05524 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms