Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P04213 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P04213 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P04213 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P04213 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P04213 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P04213 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P04213 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P04213 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P04213 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
P04213 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P04213 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P04213 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P04213 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P04213 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P04213 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P04213 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P04213 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P04213 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P04213 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P04213 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P04213 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P04213 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P04213 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P04213 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P04213 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P04213 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
P04213 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P04213 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P04213 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P04213 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P04213 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P04213 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P04213 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P04213 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P04213 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P04213 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P04213 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P04213 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P04213 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P04213 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P04213 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P04213 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P04213 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
P04213 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
P04213 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P04213 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P04213 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P04213 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
P04213 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P04213 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P04213 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P04213 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P04213 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P04213 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P04213 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P04213 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P04213 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P04213 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P04213 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P04213 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P04213 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P04213 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P04213 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P04213 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P04213 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P04213 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P04213 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P04213 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P04213 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P04213 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P04213 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P04213 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P04213 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P04213 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P04213 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P04213 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P04213 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P04213 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P04213 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P04213 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P04213 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P04213 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P04213 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P04213 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
P04213 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P04213 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P04213 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P04213 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P04213 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P04213 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P04213 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P04213 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P04213 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P04213 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P04213 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P04213 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P04213 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P04213 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P04213 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms