Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt1P04104 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt1P04104 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt1P04104 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt1P04104 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt1P04104 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt1P04104 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt1P04104 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt1P04104 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt1P04104 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt1P04104 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt1P04104 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt1P04104 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt1P04104 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt1P04104 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt1P04104 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt1P04104 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt1P04104 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt1P04104 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt1P04104 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt1P04104 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt1P04104 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt1P04104 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt1P04104 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt1P04104 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt1P04104 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt1P04104 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt1P04104 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt1P04104 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt1P04104 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt1P04104 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt1P04104 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt1P04104 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt1P04104 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt1P04104 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt1P04104 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt1P04104 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt1P04104 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt1P04104 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt1P04104 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt1P04104 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt1P04104 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt1P04104 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt1P04104 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt1P04104 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt1P04104 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms