Protein–RNA interactions for Protein: P01915

H-2 class II histocompatibility antigen, E-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01915 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01915 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01915 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01915 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01915 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01915 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01915 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01915 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01915 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01915 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01915 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01915 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01915 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01915 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01915 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01915 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01915 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
P01915 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01915 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01915 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01915 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
P01915 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01915 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01915 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01915 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01915 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01915 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01915 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01915 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01915 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01915 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01915 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01915 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01915 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01915 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01915 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01915 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01915 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01915 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01915 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01915 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01915 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01915 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01915 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01915 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01915 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01915 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01915 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P01915 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01915 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01915 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01915 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01915 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01915 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01915 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01915 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01915 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01915 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01915 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01915 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01915 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01915 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01915 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01915 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01915 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01915 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01915 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01915 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01915 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01915 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01915 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01915 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01915 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01915 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01915 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01915 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01915 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01915 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01915 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01915 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01915 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01915 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01915 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01915 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01915 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01915 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01915 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01915 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01915 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01915 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01915 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01915 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01915 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01915 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01915 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01915 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01915 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01915 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01915 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01915 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms