Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01853 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01853 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01853 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01853 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01853 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01853 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
P01853 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01853 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01853 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01853 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01853 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01853 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01853 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01853 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01853 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01853 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01853 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01853 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01853 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01853 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
P01853 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01853 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01853 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
P01853 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01853 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01853 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01853 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01853 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01853 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01853 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01853 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01853 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01853 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01853 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01853 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
P01853 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01853 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01853 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01853 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01853 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01853 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01853 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01853 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01853 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01853 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01853 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01853 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01853 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01853 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01853 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01853 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01853 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01853 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01853 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01853 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01853 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01853 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01853 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01853 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01853 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01853 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01853 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01853 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01853 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01853 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01853 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01853 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01853 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01853 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P01853 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01853 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01853 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01853 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01853 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01853 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01853 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01853 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01853 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01853 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01853 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01853 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01853 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01853 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01853 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01853 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01853 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01853 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01853 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01853 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01853 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01853 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01853 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01853 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01853 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01853 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01853 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01853 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01853 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01853 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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