Protein–RNA interactions for Protein: P01798

Ig heavy chain V-III region E109, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01798 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01798 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01798 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01798 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01798 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01798 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01798 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01798 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01798 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01798 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01798 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01798 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01798 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01798 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01798 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01798 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01798 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01798 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01798 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01798 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01798 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01798 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01798 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01798 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01798 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01798 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01798 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01798 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01798 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01798 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01798 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01798 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01798 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01798 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01798 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01798 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01798 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01798 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01798 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01798 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01798 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01798 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01798 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01798 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01798 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01798 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01798 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01798 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01798 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01798 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01798 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01798 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01798 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01798 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01798 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01798 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01798 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01798 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01798 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01798 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01798 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01798 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01798 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01798 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01798 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01798 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01798 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01798 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01798 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01798 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01798 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01798 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01798 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01798 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01798 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01798 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01798 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01798 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01798 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01798 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01798 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01798 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01798 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01798 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01798 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01798 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01798 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P01798 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01798 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01798 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01798 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01798 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01798 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01798 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01798 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01798 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01798 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01798 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01798 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01798 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms