Protein–RNA interactions for Protein: P01797

Ig heavy chain V-III region U61, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01797 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01797 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01797 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01797 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01797 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01797 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
P01797 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01797 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01797 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01797 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
P01797 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01797 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
P01797 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01797 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01797 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01797 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01797 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01797 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01797 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01797 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01797 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01797 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01797 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01797 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01797 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01797 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01797 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01797 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01797 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01797 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01797 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01797 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01797 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01797 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01797 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01797 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01797 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01797 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01797 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01797 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01797 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01797 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01797 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01797 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01797 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01797 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01797 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01797 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01797 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01797 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01797 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01797 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01797 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01797 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01797 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01797 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01797 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01797 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01797 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01797 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01797 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01797 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01797 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01797 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01797 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01797 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01797 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01797 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01797 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01797 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01797 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01797 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01797 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01797 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01797 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01797 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01797 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01797 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01797 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01797 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01797 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01797 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01797 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01797 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01797 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01797 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01797 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01797 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01797 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01797 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01797 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01797 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01797 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01797 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01797 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01797 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01797 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01797 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01797 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01797 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms