Protein–RNA interactions for Protein: P01029

C4b, Complement C4-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4bP01029 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C4bP01029 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
C4bP01029 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C4bP01029 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C4bP01029 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C4bP01029 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C4bP01029 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C4bP01029 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C4bP01029 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C4bP01029 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C4bP01029 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C4bP01029 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C4bP01029 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C4bP01029 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C4bP01029 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C4bP01029 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C4bP01029 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C4bP01029 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4bP01029 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C4bP01029 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4bP01029 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4bP01029 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4bP01029 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4bP01029 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4bP01029 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4bP01029 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4bP01029 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4bP01029 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4bP01029 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4bP01029 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C4bP01029 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C4bP01029 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C4bP01029 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C4bP01029 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C4bP01029 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
C4bP01029 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C4bP01029 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C4bP01029 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C4bP01029 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C4bP01029 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C4bP01029 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4bP01029 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4bP01029 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4bP01029 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4bP01029 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4bP01029 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4bP01029 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4bP01029 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4bP01029 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C4bP01029 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C4bP01029 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4bP01029 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4bP01029 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4bP01029 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4bP01029 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4bP01029 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4bP01029 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C4bP01029 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C4bP01029 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C4bP01029 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C4bP01029 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C4bP01029 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C4bP01029 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C4bP01029 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C4bP01029 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C4bP01029 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C4bP01029 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C4bP01029 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C4bP01029 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C4bP01029 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C4bP01029 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C4bP01029 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C4bP01029 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C4bP01029 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C4bP01029 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C4bP01029 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C4bP01029 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C4bP01029 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C4bP01029 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
C4bP01029 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C4bP01029 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C4bP01029 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C4bP01029 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C4bP01029 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C4bP01029 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C4bP01029 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C4bP01029 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4bP01029 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C4bP01029 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4bP01029 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4bP01029 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4bP01029 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4bP01029 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4bP01029 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4bP01029 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4bP01029 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4bP01029 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C4bP01029 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C4bP01029 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C4bP01029 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms