Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casp8O89110 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casp8O89110 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casp8O89110 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casp8O89110 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casp8O89110 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casp8O89110 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Casp8O89110 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casp8O89110 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casp8O89110 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casp8O89110 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Casp8O89110 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Casp8O89110 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Casp8O89110 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Casp8O89110 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Casp8O89110 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Casp8O89110 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Casp8O89110 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Casp8O89110 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Casp8O89110 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Casp8O89110 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Casp8O89110 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Casp8O89110 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Casp8O89110 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Casp8O89110 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Casp8O89110 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Casp8O89110 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Casp8O89110 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Casp8O89110 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Casp8O89110 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Casp8O89110 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Casp8O89110 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Casp8O89110 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Casp8O89110 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Casp8O89110 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Casp8O89110 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Casp8O89110 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Casp8O89110 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Casp8O89110 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Casp8O89110 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Casp8O89110 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Casp8O89110 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Casp8O89110 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Casp8O89110 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Casp8O89110 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Casp8O89110 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casp8O89110 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casp8O89110 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casp8O89110 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Casp8O89110 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms