Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MscO88940 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MscO88940 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MscO88940 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MscO88940 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MscO88940 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MscO88940 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MscO88940 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MscO88940 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MscO88940 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MscO88940 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MscO88940 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MscO88940 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MscO88940 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MscO88940 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MscO88940 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MscO88940 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MscO88940 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MscO88940 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MscO88940 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MscO88940 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MscO88940 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MscO88940 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MscO88940 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MscO88940 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MscO88940 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MscO88940 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MscO88940 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MscO88940 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MscO88940 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MscO88940 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MscO88940 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MscO88940 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MscO88940 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MscO88940 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MscO88940 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MscO88940 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MscO88940 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MscO88940 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MscO88940 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MscO88940 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MscO88940 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MscO88940 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MscO88940 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MscO88940 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MscO88940 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MscO88940 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MscO88940 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MscO88940 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MscO88940 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MscO88940 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MscO88940 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MscO88940 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MscO88940 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MscO88940 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MscO88940 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MscO88940 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MscO88940 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MscO88940 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MscO88940 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MscO88940 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MscO88940 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MscO88940 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MscO88940 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MscO88940 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MscO88940 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MscO88940 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MscO88940 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MscO88940 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MscO88940 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MscO88940 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MscO88940 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MscO88940 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MscO88940 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MscO88940 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MscO88940 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MscO88940 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MscO88940 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MscO88940 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MscO88940 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MscO88940 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MscO88940 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MscO88940 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MscO88940 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MscO88940 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MscO88940 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MscO88940 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MscO88940 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MscO88940 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MscO88940 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MscO88940 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MscO88940 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MscO88940 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MscO88940 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MscO88940 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MscO88940 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MscO88940 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MscO88940 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MscO88940 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MscO88940 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms