Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClppO88696 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClppO88696 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClppO88696 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClppO88696 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClppO88696 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClppO88696 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClppO88696 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClppO88696 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClppO88696 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClppO88696 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClppO88696 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClppO88696 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClppO88696 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClppO88696 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClppO88696 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClppO88696 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClppO88696 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClppO88696 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClppO88696 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClppO88696 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClppO88696 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClppO88696 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClppO88696 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClppO88696 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClppO88696 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClppO88696 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClppO88696 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClppO88696 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ClppO88696 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ClppO88696 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ClppO88696 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClppO88696 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClppO88696 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClppO88696 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClppO88696 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClppO88696 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClppO88696 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClppO88696 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClppO88696 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClppO88696 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClppO88696 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClppO88696 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClppO88696 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ClppO88696 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClppO88696 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClppO88696 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClppO88696 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClppO88696 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClppO88696 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClppO88696 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClppO88696 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClppO88696 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClppO88696 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClppO88696 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClppO88696 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClppO88696 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClppO88696 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClppO88696 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClppO88696 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClppO88696 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClppO88696 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClppO88696 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClppO88696 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClppO88696 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ClppO88696 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClppO88696 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClppO88696 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClppO88696 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClppO88696 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClppO88696 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClppO88696 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClppO88696 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClppO88696 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClppO88696 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClppO88696 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClppO88696 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClppO88696 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClppO88696 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClppO88696 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClppO88696 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClppO88696 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClppO88696 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClppO88696 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClppO88696 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClppO88696 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ClppO88696 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClppO88696 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClppO88696 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClppO88696 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClppO88696 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClppO88696 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClppO88696 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClppO88696 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClppO88696 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClppO88696 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClppO88696 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ClppO88696 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClppO88696 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ClppO88696 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms