Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnnal1O88327 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnnal1O88327 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnnal1O88327 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnnal1O88327 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnnal1O88327 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnnal1O88327 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnnal1O88327 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnnal1O88327 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ctnnal1O88327 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnal1O88327 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnal1O88327 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms