Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SfnO70456 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SfnO70456 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SfnO70456 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SfnO70456 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SfnO70456 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SfnO70456 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SfnO70456 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SfnO70456 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SfnO70456 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SfnO70456 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SfnO70456 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SfnO70456 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SfnO70456 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SfnO70456 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SfnO70456 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SfnO70456 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SfnO70456 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SfnO70456 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SfnO70456 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SfnO70456 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SfnO70456 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SfnO70456 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SfnO70456 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SfnO70456 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SfnO70456 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SfnO70456 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SfnO70456 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SfnO70456 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SfnO70456 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SfnO70456 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SfnO70456 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SfnO70456 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SfnO70456 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SfnO70456 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SfnO70456 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SfnO70456 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SfnO70456 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SfnO70456 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SfnO70456 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SfnO70456 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SfnO70456 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SfnO70456 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SfnO70456 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SfnO70456 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SfnO70456 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SfnO70456 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SfnO70456 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SfnO70456 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SfnO70456 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SfnO70456 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SfnO70456 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SfnO70456 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SfnO70456 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SfnO70456 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SfnO70456 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SfnO70456 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SfnO70456 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SfnO70456 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SfnO70456 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SfnO70456 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SfnO70456 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SfnO70456 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SfnO70456 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SfnO70456 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SfnO70456 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SfnO70456 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SfnO70456 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SfnO70456 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SfnO70456 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SfnO70456 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SfnO70456 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SfnO70456 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SfnO70456 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SfnO70456 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SfnO70456 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SfnO70456 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SfnO70456 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SfnO70456 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SfnO70456 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SfnO70456 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SfnO70456 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SfnO70456 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SfnO70456 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SfnO70456 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SfnO70456 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SfnO70456 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SfnO70456 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SfnO70456 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SfnO70456 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SfnO70456 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SfnO70456 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SfnO70456 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SfnO70456 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SfnO70456 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SfnO70456 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SfnO70456 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SfnO70456 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SfnO70456 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SfnO70456 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms