Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Xirp1O70373 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms