Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chrna4O70174 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrna4O70174 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms