Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlx3O55144 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlx3O55144 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlx3O55144 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlx3O55144 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlx3O55144 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlx3O55144 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlx3O55144 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlx3O55144 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlx3O55144 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlx3O55144 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlx3O55144 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlx3O55144 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlx3O55144 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlx3O55144 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlx3O55144 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlx3O55144 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlx3O55144 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlx3O55144 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlx3O55144 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlx3O55144 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlx3O55144 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlx3O55144 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlx3O55144 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlx3O55144 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlx3O55144 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlx3O55144 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlx3O55144 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlx3O55144 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlx3O55144 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlx3O55144 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlx3O55144 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlx3O55144 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlx3O55144 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlx3O55144 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlx3O55144 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlx3O55144 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms