Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PrxO55103 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PrxO55103 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PrxO55103 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PrxO55103 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PrxO55103 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PrxO55103 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PrxO55103 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PrxO55103 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PrxO55103 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PrxO55103 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PrxO55103 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PrxO55103 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PrxO55103 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PrxO55103 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PrxO55103 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PrxO55103 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PrxO55103 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PrxO55103 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PrxO55103 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PrxO55103 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PrxO55103 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PrxO55103 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PrxO55103 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PrxO55103 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PrxO55103 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PrxO55103 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PrxO55103 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PrxO55103 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PrxO55103 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PrxO55103 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PrxO55103 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PrxO55103 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PrxO55103 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PrxO55103 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PrxO55103 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PrxO55103 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PrxO55103 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PrxO55103 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PrxO55103 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PrxO55103 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PrxO55103 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PrxO55103 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PrxO55103 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PrxO55103 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PrxO55103 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PrxO55103 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PrxO55103 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PrxO55103 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PrxO55103 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PrxO55103 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PrxO55103 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PrxO55103 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PrxO55103 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PrxO55103 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PrxO55103 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PrxO55103 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PrxO55103 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PrxO55103 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PrxO55103 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PrxO55103 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PrxO55103 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PrxO55103 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PrxO55103 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PrxO55103 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PrxO55103 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PrxO55103 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PrxO55103 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PrxO55103 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PrxO55103 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PrxO55103 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PrxO55103 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PrxO55103 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PrxO55103 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PrxO55103 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PrxO55103 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PrxO55103 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PrxO55103 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PrxO55103 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PrxO55103 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PrxO55103 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PrxO55103 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PrxO55103 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PrxO55103 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PrxO55103 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PrxO55103 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PrxO55103 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PrxO55103 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PrxO55103 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PrxO55103 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PrxO55103 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PrxO55103 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PrxO55103 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PrxO55103 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PrxO55103 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PrxO55103 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PrxO55103 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PrxO55103 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PrxO55103 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PrxO55103 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms