Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trappc3O55013 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc3O55013 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc3O55013 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms